金线莲基原植物种子无菌培养，一般釆集未开裂的成熟蒴果，自来水冲洗干净后，用75%乙醇棉擦拭果皮，再置于10%次氯酸钠溶液中浸泡10~12分钟，用无菌水冲洗5~6次，然后用解剖针将消毒后的蒴果纵向剖成两半，镊子夹取少量种子，撒入培养基中。种子萌发形成原球茎后，原球茎可以直接发育成幼苗，也可以由原球茎产生愈伤组织，再由愈伤组织发育成类原球茎而分化成幼苗。
一般情反卡，种子接种在培养基上1~2周后，吸水膨大，种胚突破种皮，出现表皮毛，4~5周时，可见白色原球茎，并于部分原球茎顶端出现分生组织，6周后，原球茎继续生长，表皮毛数量和长度也相应增加，并开始出现第1片叶的形态，持续至10~12周，形成具有1~2片小叶的幼苗。
周伟香等（2007)对种子萌发、原球茎增殖和分化进行研究，发现种子萌发最适条件为光照12小时/天，光照度1000~1500lx，温度（23±2)℃，液体悬浮培养的转速为60r/min，培养基1/4MS+NAA0.1~0.5mg/L+蔗糖20g/L；原球茎增殖最佳培养基为改良KC+6-BA2.0mg/L+NAA1.5mg/L+KT0.2mg/L，原球茎分化最佳培养基为改良KC+6-BA1.0mg/L+NAA0.5mg/L。罗安雄等(2012)考察了不同培养基对金线莲幼苗生长的影响，发现幼苗生长适宜培养基为1/2MS+NAA1.0mg/L+6-BA2.0mg/L。何荆洲等（2014)比较培养基成分、植物生长调节剂组合及添加物对金线莲无菌播种膨大率及萌发率的影响，结果表明，种子在WPM培养基上的膨大萌发率最高；适当添加NAA和有机物对种子的膨大萌发有促进作用。
此外授粉类型对金线莲种子萌发影响较大，异株异花授粉所得种子的萌发率最高，种子的萌发率随冷藏时间的延长而降低，使用次氯酸钠浸泡后.的种子与对照相比，其萌发率无明显差异。