金线莲分布于亚洲热带和***带地区，主要分布在中国、日本、印度、斯里兰卡、尼泊尔及东南亚各国。在我国主要分布于福建、浙江、江西、广东、广西、云南、台湾等省份，其中以福建、浙江、江西为主产地。金线莲不同基原植物野外生境相似，分布于常绿阔叶林的沟边、石壁及土质松散的潮湿地带。
金线莲主要基原植物为金线莲，此外台湾金线莲、恒春银线兰及滇越金线兰也作为金线莲药材使用。金线莲和滇越金线兰叶片表面具金红色有绢丝光泽的网脉，金线莲叶片为卵圆形或卵形，背面淡紫红色，滇越金线兰叶片为偏斜的卵形，背面淡绿色；滇越金线兰的花期早于金线莲。金线莲地理分布区域较广，而滇越金线兰主要分布于云南屏边地区。台湾金线莲和恒春银线兰叶片表面具白色的网脉，台湾金线莲花不甚张开，倒置（唇瓣位于下方），子房扭转，恒春银线兰花张开，不倒置（唇瓣位于上方），子房不扭转；恒春银线兰的花期早于台湾金线莲。台湾金线莲和恒春银线兰主要分布于台湾地区，近年来福建、浙江、江西等地开始引种。
金线莲人工栽培的种源来自于野生资源，品系混杂，产量与内在品质不稳定，严重影响着药材的质量。选育出产量高、质量稳定、适应性强的优良品种是发展金线莲产业的重要基础。根据叶片形状和茎秆颜色，金线莲经过长期不断的人工选择，目前形成3个主要栽培类型，分别为尖叶红秆金线莲、尖叶绿秆金线莲、圆叶红秆金线莲。尖叶红秆金线莲叶片狭长，叶端较尖或微凸，表面呈茸毛状黑紫色，背面淡红色，茎肉质，红色。尖叶绿秆金线莲叶片狭长，叶端较尖或微凸，表面呈茸毛状黑紫色，背面淡红色，茎肉质，淡绿色。
圆叶红秆金线莲叶片呈椭圆形或近圆形，叶端钝圆，表面暗紫色，背面淡紫红色，茎肉质，淡红色。